MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS8232 chromosome

Total Repeats: 40305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003485	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003485	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003485	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003485	A	6	6	40	45	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003485	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003485	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003485	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	19745202
8	NC_003485	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	19745202
9	NC_003485	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745202
10	NC_003485	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	19745202
11	NC_003485	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745202
12	NC_003485	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745202
13	NC_003485	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	19745202
14	NC_003485	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745202
15	NC_003485	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745202
16	NC_003485	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745202
17	NC_003485	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	19745202
18	NC_003485	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745202
19	NC_003485	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	19745202
20	NC_003485	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745202
21	NC_003485	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	19745202
22	NC_003485	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	19745202
23	NC_003485	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745202
24	NC_003485	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745202
25	NC_003485	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	19745202
26	NC_003485	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745202
27	NC_003485	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745202
28	NC_003485	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	19745202
29	NC_003485	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	19745202
30	NC_003485	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745202
31	NC_003485	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745202
32	NC_003485	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745202
33	NC_003485	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745202
34	NC_003485	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745202
35	NC_003485	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	19745202
36	NC_003485	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_003485	TC	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_003485	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003485	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003485	CTA	3	9	1666	1674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_003485	TTA	3	9	1676	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003485	TTA	2	6	1688	1693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003485	ATT	2	6	1735	1740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
44	NC_003485	CTATTC	2	12	1788	1799	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19745203
45	NC_003485	TCA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745203
46	NC_003485	GTAA	2	8	1886	1893	50 %	25 %	25 %	0 %	19745203
47	NC_003485	TTA	2	6	1934	1939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
48	NC_003485	T	7	7	1948	1954	0 %	100 %	0 %	0 %	19745203
49	NC_003485	ATT	2	6	1961	1966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
50	NC_003485	AAC	2	6	2007	2012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745203
51	NC_003485	GTT	2	6	2018	2023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745203
52	NC_003485	AAG	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745203
53	NC_003485	ATT	2	6	2128	2133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
54	NC_003485	TAT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
55	NC_003485	GTC	2	6	2181	2186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745203
56	NC_003485	GACT	2	8	2245	2252	25 %	25 %	25 %	25 %	19745203
57	NC_003485	CAG	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745203
58	NC_003485	GA	3	6	2332	2337	50 %	0 %	50 %	0 %	19745203
59	NC_003485	CAG	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745203
60	NC_003485	GAT	2	6	2357	2362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745203
61	NC_003485	TTA	2	6	2471	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
62	NC_003485	GTT	2	6	2498	2503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745203
63	NC_003485	CTT	2	6	2542	2547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19745203
64	NC_003485	GGTAA	2	10	2633	2642	40 %	20 %	40 %	0 %	19745203
65	NC_003485	AGTC	2	8	2663	2670	25 %	25 %	25 %	25 %	19745203
66	NC_003485	GAA	2	6	2801	2806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745203
67	NC_003485	AATT	2	8	2817	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	19745203
68	NC_003485	TAAG	2	8	2843	2850	50 %	25 %	25 %	0 %	19745203
69	NC_003485	T	7	7	2871	2877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003485	TTA	2	6	2879	2884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003485	ATA	2	6	2897	2902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003485	TGAAA	2	10	2943	2952	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003485	A	6	6	2950	2955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003485	ATG	2	6	3064	3069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003485	A	7	7	3096	3102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003485	TAAA	2	8	3127	3134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003485	A	6	6	3169	3174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003485	AGA	2	6	3220	3225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003485	AAT	2	6	3298	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003485	TCT	2	6	3370	3375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_003485	TCT	2	6	3392	3397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_003485	T	6	6	3399	3404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003485	TAA	2	6	3409	3414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003485	TTGA	2	8	3417	3424	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003485	CAG	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745204
86	NC_003485	GCT	2	6	3531	3536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745204
87	NC_003485	TGGTA	2	10	3569	3578	20 %	40 %	40 %	0 %	19745204
88	NC_003485	A	7	7	3627	3633	100 %	0 %	0 %	0 %	19745204
89	NC_003485	AAAT	2	8	3707	3714	75 %	25 %	0 %	0 %	19745204
90	NC_003485	TGA	3	9	3767	3775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745204
91	NC_003485	TCAA	2	8	3873	3880	50 %	25 %	0 %	25 %	19745204
92	NC_003485	A	6	6	3901	3906	100 %	0 %	0 %	0 %	19745204
93	NC_003485	AGA	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
94	NC_003485	GTT	2	6	4029	4034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745204
95	NC_003485	AAC	2	6	4052	4057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745204
96	NC_003485	CAAA	2	8	4127	4134	75 %	0 %	0 %	25 %	19745204
97	NC_003485	AGT	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745204
98	NC_003485	AGA	3	9	4190	4198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
99	NC_003485	AGA	2	6	4226	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
100	NC_003485	AGC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745204
101	NC_003485	ATC	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745204
102	NC_003485	CAG	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745204
103	NC_003485	GCT	2	6	4380	4385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745204
104	NC_003485	TAT	2	6	4388	4393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745204
105	NC_003485	ATG	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745204
106	NC_003485	AAG	2	6	4480	4485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
107	NC_003485	GAA	2	6	4500	4505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
108	NC_003485	GTT	2	6	4518	4523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745204
109	NC_003485	CAT	2	6	4535	4540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745204
110	NC_003485	GAA	2	6	4590	4595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003485	TTG	2	6	4645	4650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745205
112	NC_003485	A	6	6	4678	4683	100 %	0 %	0 %	0 %	19745205
113	NC_003485	GAT	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745205
114	NC_003485	TTA	2	6	4786	4791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745205
115	NC_003485	CTA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745205
116	NC_003485	AAT	2	6	4833	4838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745205
117	NC_003485	CTA	2	6	4868	4873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745205
118	NC_003485	ATG	2	6	4906	4911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745205
119	NC_003485	TTACGT	2	12	4935	4946	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	19745205
120	NC_003485	CAG	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745205
121	NC_003485	GAC	2	6	5038	5043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745205
122	NC_003485	TTA	2	6	5062	5067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745205
123	NC_003485	ATA	2	6	5098	5103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745205
124	NC_003485	TTTA	2	8	5149	5156	25 %	75 %	0 %	0 %	19745205
125	NC_003485	A	6	6	5173	5178	100 %	0 %	0 %	0 %	19745205
126	NC_003485	ATT	2	6	5218	5223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
127	NC_003485	ACC	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	19745206
128	NC_003485	GAT	2	6	5339	5344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
129	NC_003485	A	9	9	5346	5354	100 %	0 %	0 %	0 %	19745206
130	NC_003485	TGA	2	6	5419	5424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
131	NC_003485	T	6	6	5441	5446	0 %	100 %	0 %	0 %	19745206
132	NC_003485	TGA	2	6	5670	5675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
133	NC_003485	TTA	2	6	5703	5708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
134	NC_003485	T	6	6	5786	5791	0 %	100 %	0 %	0 %	19745206
135	NC_003485	GAT	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
136	NC_003485	AAC	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745206
137	NC_003485	TTA	2	6	5865	5870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
138	NC_003485	ATA	2	6	5955	5960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745206
139	NC_003485	A	6	6	5960	5965	100 %	0 %	0 %	0 %	19745206
140	NC_003485	AGA	2	6	5974	5979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745206
141	NC_003485	A	6	6	5995	6000	100 %	0 %	0 %	0 %	19745206
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272	NC_003485	AGC	2	6	11198	11203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745210
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274	NC_003485	TAT	2	6	11234	11239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745210
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411	NC_003485	A	6	6	16839	16844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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